Title / Titre :
Puces à ADN : Technologie et Données

Author(s) / Auteur(s) :
Christelle Thibault

Address / Adresse :
IGBMC, Parc d'Innovation,
1 rue Laurent Fries, BP 163
67404 Illkirch cedex, France
E-mail : thibault@titus.u-strasbg.fr

Key words / Mots clés :

Abstract / Résumé : La technique des puces à ADN apparaît comme une technologie leader dans le domaine de la génomique fonctionnelle, une discipline récente qui vise à étudier la séquence et la fonction des gènes à l'échelle du génome. En substance, les puces à ADN sont des petits supports sur lesquels sont attachés des milliers de séquence d'ADN à des adresses connues disponibles pour appariement avec des ADN ou des ARN cibles marqués avec des molécules fluorescentes ou radioactives. Leurs multiples applications comprennent la cartographie ou le dosage de gènes, la détection de mutation ou encore la quantification du niveau d'expression de gènes.

Dans cet article nous nous concentrerons sur les puces d'expression destinées à évaluer la représentation absolue de milliers d'espèces d'ARN messager dans une cellule ou un tissu simultanément ou à mesurer leur abondance relative entre deux ou plusieurs échantillons. Nous présenterons les différentes techniques utilisées depuis la fabrication des puces jusqu'à l'obtention des données d'expression et nous discuterons de l'accessibilité de cette technologie d'un point de vue coût. Enfin, nous évoquerons les défis à relever pour analyser la masse des données générées.